在浩瀚的宇宙中，经过长期岁月辗转，被秘密选召出的四个小动物，作为“迷你特工队”保护地球的和平，他们是最强战士：弗特、塞米、露西、麦克斯！迷你特工队为保护地球，与邪恶势力展开了激烈的战斗！

曾经让整个宇宙都感到恐惧的杰苏，为了夺回了他的力量而来到了地球。他利用人类的负面情感作为他的力量源泉。杰苏和他的手下丹丹团三人把各式各样拥有着超能力的外星人带到地球，破坏人们的家园。而在另一个城市里，天才科学家里奥正注视着迷你特工队的一举一动，他到底是敌是友……

在队友和盟友的帮助下，迷你特工队与敌人展开一系列惊险刺激的搏斗，凭借默契的团队合作和坚定不屈的信念，迷你特工队取得了最终的胜利。