故事讲述了一个现代人穿越到忍界，成为宇智波一族成员宇智波心赖的故事。心赖在被蛇咬后意外穿越，醒来时恰逢宇智波一族灭族事件，被纲手救助并带回木叶村。他与幸存的宇智波佐助一同生活，展现出与原著不同的性格和态度，对宇智波灭族事件显得异常冷静。心赖在木叶村逐渐融入忍者生活，利用自己对原剧情的了解，试图改变某些事件的发展。小说中还涉及了心赖与其他角色如纲手、佐助、红裳等的互动，以及他在执行任务过程中的各种经历。随着时间推进，心赖不仅成长为一名强大的忍者，还卷入了更为复杂的忍界斗争中，包括对抗神秘的敌人、参与五影会谈、保护楼兰遗民等情节。整个故事展现了心赖如何在充满挑战和危险的忍者世界中生存，同时保持自己的个性和幽默感，以及他如何影响周围人物的命运。