故事讲述了11岁的孙小圣与姜小满因发现变异幼鲨、听闻海洋怪事，成立了“海洋侦探社”，借得姜爷爷发明的“蓝色海豚号”潜艇探秘的故事。
航行中，他们遇到巨型鲨鱼鲨洛克与助手蟹大侠——这对会说人话的正宗“海洋侦探”正在追查“黑水流”。从冲突到合作，四人组沿太平洋、北冰洋、大西洋、印度洋等航线，发现变异生物、辐射超标等异常，最终锁定东圆国偷倒核废料、建秘密核基地的阴谋。他们联合海洋动物反击，冒险拍摄证据，全球曝光，迫使污染者收手，展现了海洋生态危机与守护家园的勇气。
故事在紧张冒险中融入了许多有关地理、洋流、核辐射、海洋生物、荒岛生存等科普知识，让你在享受精彩故事时，也能学到多方面有趣的知识。